فناوری ژنوتیپ شناسایی انواع کووید را سرعت می بخشد

بر اساس تحقیقات دانشگاه آنگلیا شرقی و آژانس امنیت سلامت بریتانیا، فناوری ژنوتیپ انواع کووید را سریعتر و ارزان تر از همیشه شناسایی می کند. مطالعه جدیدی که امروز منتشر شد نشان می‌دهد که این روش تقریباً یک هفته سریع‌تر از روش‌های سنتی توالی‌یابی کل ژنوم، انواع جدید را شناسایی می‌کند.

تیم تحقیقاتی می‌گوید که ژنوتیپ کردن به اطلاعات نوع کووید اجازه می‌دهد با سرعت بیشتری شناسایی و به متخصصان حفاظت از سلامت خط مقدم در اوج همه‌گیری منتقل شود. نکته مهم این است که به اجرای سریع اقدامات کنترل محلی مانند ردیابی تماس کمک کرد.

پروفسور ایین لیک، محقق ارشد، از دانشکده علوم محیطی UEA، گفت: «زمانی که همه‌گیری کووید شروع شد، نوع آلوده شدن افراد در ابتدا با استفاده از یک تکنیک بسیار دقیق به نام توالی‌یابی کل ژنوم مشخص شد. “این ابزار تشخیصی استاندارد طلایی برای شناسایی و تعیین ژنتیکی انواع است. اما در جایی که جمعیت های بزرگ باید به سرعت ارزیابی شوند – پس هزینه، ظرفیت و به موقع بودن کاربرد آن را محدود می کند.

«در آغاز سال 2021، فناوری جدید برای شناسایی سریع انواع جدید توسط دولت در آزمایشگاه‌های تست و ردیابی NHS آزمایش می‌شد. این فناوری که به نام «آزمایش سنجش ژنوتیپ» یا ژنوتیپ شناخته می‌شود، به دانشمندان اجازه می‌دهد تا انواع ژنتیکی را بررسی کنند.»

تیم تحقیقاتی داده‌های بیش از 115000 مورد را مطالعه کرد که در آن اطلاعات نوع کووید از هر دو ژنوتیپ و توالی‌یابی کل ژنوم در دسترس بود. با مقایسه نتایج واریانت از ژنوتیپ با نتایج حاصل از توالی یابی کل ژنوم، آنها نشان دادند که نتایج ژنوتیپ بسیار دقیق است. پروفسور لیک گفت: “ما دریافتیم که ژنوتیپ قادر است انواع شناخته شده کووید را سریعتر و ارزان تر از توالی یابی کل ژنوم تشخیص دهد.

آنها نتایج متفاوتی را شش روز سریع‌تر از توالی‌یابی کل ژنوم تولید کردند با نتایج تنها در سه روز، در مقایسه با ۹ روز برای توالی‌یابی کل ژنوم. ژنوتیپ باعث افزایش 9 برابری در تعداد نمونه های آزمایش شده برای انواع مختلف شد. بنابراین اقدامات کنترل محلی مانند ردیابی تماس می تواند با سرعت بیشتری انجام شود.

ژنوتیپ را می توان برای یافتن انواع مختلف در طیف گسترده ای از موجودات در انسان و حیوانات به کار برد – بنابراین پتانسیل بسیار زیادی برای هدایت تصمیم گیری در مورد سلامت عمومی و کنترل بیماری در سطح جهانی در آینده دارد.

پروفسور سوزان هاپکینز، مشاور ارشد پزشکی UKHSA، گفت: “تخصص ژنومیک پیشرو در جهان که UKHSA و سایر موسسات در سراسر بریتانیا توانستند در سراسر همه‌گیری از آن استفاده کنند، برای پاسخ بریتانیا به COVID-19 بسیار مهم است. “تحقیقاتی مانند این به ما کمک می کند تا به توانایی های خود در این زمینه ادامه دهیم و اطمینان حاصل کنیم که بریتانیا تا حد امکان برای پاسخ سریع به تهدیدات در حال ظهور برای سلامت عمومی در آینده آماده است.”

پروفسور Dame Anna Dominiczak، دانشمند ارشد بهداشت در اسکاتلند که قبلاً عملیات دولت بریتانیا برای گسترش و اداره آزمایشگاه‌های فانوس دریایی کووید را رهبری می‌کرد، گفت: «تحقیقاتی مانند این واقعاً مهم است تا اطمینان حاصل شود که ما بر اساس پیشرفت‌های عظیم در آزمایش انجام شده است. در طول کووید برای تقویت سیستم دفاعی خود در برابر تهدیدات همه گیر آینده.” این کار توسط UKHSA و مؤسسه ملی تحقیقات بهداشت و مراقبت (NIHR) واحد تحقیقات حفاظت از سلامت در آمادگی و واکنش اضطراری تامین شد.